Май 1564 г. След бруталното убийство на самурай в една от чайните на Киото изкусният нинджа Хиро не проявява желание да се забърква в историята. Но красивата артистка, обвинена в престъплението, разчита единствено на помощта на отец Матео – португалския йезуит, когото Хиро се е заклел да пазис живота си. Изкусният шиноби има само три дни да открие убиеца, за да спаси момичето и свещеника от екзекуция.

Разследването потапя Хиро и отец Матео в опасните води на хедонистичния свят в Киото, където научават, че всеки – от предпазливата собственичка на чайната до опозорения брат на мъртвеца – има мотив да крие факти около убийството на самурая. Рядкото оръжие на убийството, използвано главно от наемни убийци, жена в облика на самурай и тайна любовна връзка оставят твърде много заподозрени и твърде малко време. И още по-лошо, докато разследва убийството, Хиро разкрива цял куп тайни, които заплашват не само отец Матео и чайната, но и бъдещето на Япония.